商标注册和营业执照是企业在经营过程中需要办理的两个重要事项，但它们的本质和功能是不同的。以下是它们的主要区别：

1. 法律依据和保护范围

商标注册：主要依据《商标法》，目的是保护商标专用权，确保商品或服务与其提供者之间具有明确的标识关系。商标注册后，权利人在指定商品或服务上享有独家使用权。

营业执照：依据《企业名称登记管理规定》，是企业合法经营的凭证，赋予企业从事相关经营活动的资格，但不直接涉及商标权的保护。

2. 功能和作用

商标注册：侧重于品牌保护和市场区分，防止他人恶意抢注、仿冒等行为。商标是企业产品或服务进入市场的要件，是消费者识别产品的标志。

营业执照：侧重于企业身份的确认和经营资格的赋予，是企业进入商海和其他商业主体竞争的资格。

3. 稳定性和归属权

商标注册：商标可以是企业字号、企业名称，也可以是其他具有显著性的标志。一个企业可以拥有多个商标，且商标可以转让或授权使用。

营业执照：通常一个企业只有一个营业执照，作为其市场主体的身份证明。营业执照的名称可以近似，但不能相同。

4. 排他性和使用范围

商标注册：注册商标具有排他性，享有专用权。商标在全国范围内连近似也不行，防止混淆。

营业执照：营业执照的名称可以近似，但不能相同。营业执照的名称在同一地区内不能重复，但在不同地区可以相同。

5. 风险和法律责任

商标注册：未注册商标使用中极易发生风险，如被他人抢注或侵权。注册商标可以有效保护企业的品牌权益。

营业执照：营业执照的登记行为并非是《商标法》所规定的商标使用行为，因此不会构成侵犯注册商标专用权。

综上所述，商标注册和营业执照在法律依据、功能作用、稳定性、排他性等方面都有显著的区别。企业在经营过程中应同时重视这两者的办理和保护。